破奴軍水師主力船隊一百七十艘戰船、兵船和糧船出現在澎湖外海北十里，并且成功將鄭芝龍船隊窩在了海港之中。鄭芝龍船隊主要首領都隨鄭芝龍回鄉祭祖，留下個七首領程虎還是個膽小如鼠之輩，面對來勢洶洶的破奴軍水師大軍，數百艘各式海船沒有一艘敢出海迎戰。鄭芝龍海盜船隊的首領們幾乎都是他的兄弟或者是近親，留程虎看家還是鄭芝龍知曉這人沒有成為大首領的本事，沒有本事的人一般也沒有什么膽氣，窩在澎湖海港等待鄭芝龍回來主事就成為了程虎唯一的選擇。

站立在澎湖大山嶼（澎湖本島）最高點拱北山上觀察破奴軍船隊的程虎，被破奴軍水師戰船強大的氣場所震懾。更讓程虎震撼的是破奴軍龐大船隊中有幾艘不小的破爛戰船，這幾艘戰船雖然殘破，程虎還是認出這是臺灣荷蘭人戰船。本來荷蘭戰船火力強大，鄭芝龍船隊數量眾多正好可以達成相互**平衡。看樣子荷蘭戰船與破奴軍已經交過手，而且是一敗涂地，程虎本身對海戰就不算精通，讓他前去跟破奴軍拼命程虎沒有這個膽氣。

也就在程虎觀察破奴軍水師被其龐大規模所震撼得不知所措之時，破奴軍水師二十艘兵船如同一只只下蛋的母雞，身邊跟隨著密密麻麻的小雞。這些看似無害的小雞正是即將登陸的破奴軍陸戰營戰兵，他們乘坐小舢板向南側沙灘撲來。破奴軍陸戰隊在小舢板靠近淺灘時紛紛跳入海水中，他們要蹚水快速沖向岸邊。只是破奴軍陸戰營戰兵在齊腰深水中蹚行時的姿態有些難看，他們雙手高舉過頭，讓火銃和子彈袋遠離海水，這讓人看起來破奴軍還沒有開戰就已經向敵人投降。

不過程虎可不敢小瞧陸戰無敵的破奴軍，連蒙古草原霸主林丹汗全家都被屠了干凈的破奴軍，鄭芝龍這些海盜在陸戰中根本就沒有獲勝的機會。看到這里，程虎也大致猜到在泉州祭拜先人的首領鄭芝龍下場，程虎猜測破奴軍能在鄭芝龍首領們都不在時進攻澎湖，很有可能是鄭芝龍已經遭遇到意外。程虎還沒有想清楚是否該抵抗，大山嶼島上的兄弟們已經炸鍋。在四面臨海的澎湖，即使是有兄弟想逃跑，也不可能沖出破奴軍水師的包圍圈。澎湖倒是個適合船隊駐扎和避風的好地方，大山嶼、西嶼島和北面白沙島構成了一個大海灣。

而鄭芝龍船隊數百艘海船幾乎全都在此駐泊，這是因為鄭芝龍在去泉州時，也害怕劉香投降的兄弟對他們不利，他特意把這些新入伙的弟兄聚集在澎湖駐扎，等他們祭祖回來后再行分配地盤。沒成想倒是給予了破奴軍水師全殲的機會，省得破奴軍水師還要去廣東沿海找尋這幫海盜的蹤跡。程虎看到破奴軍約三千戰兵在沙灘上列陣擺出了一個松散魚鱗陣后，他下令不予抵抗投降破奴軍。可這些海盜中還是有許多不服氣的人，他們在各自小頭目的帶領下想挑戰破奴軍。這些盔甲都不齊備的海盜，連陣型都不要一窩蜂沖向破奴軍火銃軍陣。

這些不要命的亡命徒大約有五百多人，他們手中武器極為繁雜，只是這幫海盜很是膽大，一聲吶喊按照海戰中跳幫作戰方式向破奴軍軍陣猛地沖來。破奴軍帶隊千總哨官張玉成，看到海盜們如此作戰差點氣的吐血。破奴軍一直在與強敵作戰，大場面見多了就對這種強盜火拼般打群架很是不屑，是個破奴軍戰兵都對這樣的戰功沒有興趣。可沒興趣也要消滅掉這些沖到眼前的敵人，三輪火銃射擊過后，戰場滿地血紅講述了雙方之間的差距是多大。

破奴軍在消滅澎湖大山嶼主島敢于反抗的海盜之后，隨即開始抓捕那些海盜中的大小頭目。隨著西嶼島和白沙島上鄭芝龍海盜團伙頭目被一一捕獲，整個澎湖作戰也逐步進入尾聲。在鄭芝龍海盜中也有許多跟破奴軍熟悉的小頭目，他們認為破奴軍占據澎湖，是改變他們命運的一次良機，這些與破奴軍水師有舊的小頭目紛紛向破奴軍表示愿意投靠破奴軍。甄別這些海盜頭目需要情報處花費不小的經歷，為簡化甄別的時間，情報處千總周興想出了個非常簡單的辦法，就是讓島上家室小頭目們繳納投名狀。

通過分開審訊的方式，情報處倒是很快摸清了鄭芝龍船隊中各條船老大的基本情況。對于有航海經驗的海盜船老大情報處是不會輕易斬殺，破奴軍水師還需要這些人干活。情報處需要被抓捕的海盜指認敢于五百多對抗破奴軍海盜們的親屬，當然了與這批亡命徒熟悉的人也在情報處需要抓捕的名單中。在情報處千總周興看來，這些人都將是未來不安定因素，需要斬草除根以絕后患。連坐是破奴軍對待敵人的慣用手段，而貫徹周興這個滅口方略的自然是那些需要交納投名狀的海盜小頭目們。